物行医购医药商场对商户的交易、结算所涉及到资金设立了一套完整的管控体系，对各项资金的流动全程监管，增强了风险的防范能力，同时采用第三方交易资金安全担保模式，最大限度地保障了资金安全。
1.制定了完善资金管理制度，增强员工制度性意识
（1）为加强资金安全管理，物行医购医药商场为使资金管理走上制度化轨道，保证资金安全管理与公司人员的意识在制度化轨道上的高度统一。
（2）建立了一整套完整的《物行医购医药商场管理制度》，让公司的资金管理方面的原则上的宏观性问题均具有制度性依据。
（3）公司严格落实资金管理制度。
（4）实行资金安全管理责任制。增强员工的责任意识，确保资金安全制度的有效执行。
2.提高资金管理人员风险意识
物行医购医药商场要求资金管理人员务必防范财务监督风险、提高资金监督质量的人力保证。其中对资金管理人员素质培养：一是提升资金管理人员综合素质。要加强思想道德教育，增强荣辱观，使其能够抵制各种诱惑，防止因道德缺失给财务监督工作带来风险。二是增强资金管理风险防范意识。定期进行风险教育、职业道德教育，通过岗位责任制和激励机制等方法，促使资金管理人员增强自身的风险防范意识，进而提高财务监督的质量。
3.引入第三方交易担保
物行医购医药商场的资金交易均通过第三方交易平台进行，公司本身对资金交易过程中只作为一个参与角色，全程的资金流向均通过有资质的第三方交易平台进行，且资金的管理基本上依托风险管理能力的第三方交易平台，与对于专业的第三方资金管理公司的合作则使金担保交易确保零风险。